Rad51/RadA/RecA

                                         190       200       210       220
                                  ----:----|----:----|----:----|----:----|----:
Consensus                         xxeqxxxxxxxxxxxxxxxxxfxxxxxxxxxxgxxxxxxxxxxxx
===============================================================================
PYROCOCCUS_FURIOSUS               avaspielkevagisegtalkiiqaarkaanlGtfmradeylkkr
Pyrococcus_abyssi                 avaspielkevagisegaalkiiqaarkaanlGtfmradeylkkr
===============================================================================
METHANOCOCCUS_VOLTAE              --fmkiatatvgeltdiegisekaaakmimgardlcdlgfksgid
Methanococcus_jannaschii          --fmkiatasigelteidgisekaaariieaarelcnlgfksgte
===============================================================================
SULFOLOBUS_SOLFATARICUS           letlavaspqdlsvaagiplstaqkiikeardaldirfktalevk
Aeropyrum_pernix                  leaiaaatpqevsqatgipiltaqkivdaarealnidfktaydlk
Desulfurococcus_amylolyticus      awsivvaraeelaertglpvltvqkiienarkmlgitfktarevk
Sulfolobus_tokodaii               leavavaspqdlsvaagiplttaqriikearealdirfktalevk
===============================================================================
HUMAN                             -eEE---------s-------F----------Gp------q---p
YEAST                             -dEa---------a-------l----------Gsf-----v---p
Apis_mellifera                    -npQ---------a--------------------------k---l
Aspergillus_fumigatus             -lpg---------p-------g----------ap------t---p
Bombyx_mandarina                  -dad---------e-------c----------Gp------q---l
Bos_taurus                        ---------------------------------------------
Caenorhabditis_elegans            -mEQ---------d-------e----------nf------t---v
Candida_albicans                  -eEd---------edvl----n----------Gp------l---l
Candida_glabrata                  -eDa---------a-------l----------asf-----v---p
Canis_lupus                       -eEE---------s-------F----------Gp------q---p
Coprinus_cinereus                 -eDy---------q-------F-s--------Gp------l---l
Cricetulus_griseus                -eEE---------s-------F----------Gp------q---p
Cryptococcus_neoformans           -e-----------s-------l----------apm-----l----
Danio_rerio                       -eEE---------n-------F----------Gp------q---p
Debaryomyces_hansenii             -eEd---------g-------ls---------Gp------l---l
Drosophila_melanogaster           -eEg---------p-------l----------------------s
Drosophila_pseudoobscura          -eEE---------e-------n----------Gp------l---n
Emericella_nidulans               -lpg---------p-------g----------ap------t---p
Encephalitozoon_cuniculi          -hsE---------s-------i----------------------s
Eremothecium_gossypii             -eEd---------v-------a----------la------af-vp
Gallus_gallus                     -eEE---------s-------F----------Gp------e---p
Gibberella_zeae                   -mpg---------p-------g----------ap------t---p
Kluyveromyces_lactis              -dDv---------a-------l----------aaf-----v---p
Mus_musculus                      -eEE---------s-------F----------Gp------q---p
Neurospora_crassa                 -ipn---------p-------g----------ap------t---p
Nosema_bombycis                   -eEE---------e-------F----------ks------ett-s
Oikopleura_dioica                 -mvg---------a-------i----------hn------d---l
Oryctolagus_cuniculus             -eEE---------s-------F----------Gp------q---p
Pichia_angusta                    -eDy---------s-------a----------Gp------v---p
Pleurotus_ostreatus               -q-----------a-------t----------Gpl-----l----
Rattus_norvegicus                 -eEE---------s-------F----------Gp------q---p
Schizosaccharomyces_pombe         -dEa---------a-------a----------Gp------m---p
Strongylocentrotus_purpuratus     -sEE-----------------F----------Gp------l---g
Tetraodon_nigroviridis            -eEE---------n-------F----------Gp------q---p
Ustilago_maydis                   -mgE---------a-------F----------Gp------l---p
Xenopus_laevis                    -eEE---------n-------F----------Gp------q---a
Xenopus_tropicalis                -eEE---------n-------F----------Gp------q---a
Yarrowia_lipolytica               -eEi---------e-------r----------aga-----i---p
Cryptosporidium_spp               -lnE---------t-------vyn--------Gp------l---k
Dictyostelium_discoideum          -eEE---------e-------e----------ee------esyls
Entamoeba_histolytica             -eEE---------e-------n----------aa------v---p
Leishmania_donovani               -epn---------a-------s----------Gf------r---v
Leishmania_tropica                -epn---------a-------s----------Gf------r---v
Plasmodium_berghei                -tEEvdehl----y-------a----------Gp------l---k
Plasmodium_falciparum             -ytg---------p-------l----------------------k
Plasmodium_yoelii                 -dEh---------l-------Y-t--------Gp------l---k
Tetrahymena_thermophila           -eQs---------d------------------Gp------m---l
Theileria_annulata                -esg---------s-------q----------np------q---r
Theileria_parva                   -etg---------s-------q----------np------q---r
Trypanosoma_brucei                -gDa---------a-------g----------Gpsf----r---v
Trypanosoma_cruzi                 -dga---------n-------n----------Gg-f----r---v
Arabidopsis_thaliana              -eEt---------q-------h----------Gpf---------p
Oryza_sativa                      -eEg---------e-------h----------Gp------f---p
Zea_mays                          --Ev---------e-------h----------Gpf---------p
===============================================================================
ECOLI                             -iEK---------q-------F----------Gk------g----
MYCOBACTERIUM_SMEGMATIS           -iDK---------n-------F----------Gk------g----
MYCOBACTERIUM_TUBERCULOSIS        -iEK---------s-------Y----------Gk------g----
Acetobacter_polyoxogenes          -iER---------a-------F----------Gk------g----
Acinetobacter_calcoaceticus       -iEK---------q-------F----------Gk------n----
Actinobacillus_pleuropneumoniae   -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Actinobacillus_succinogenes       -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Bacillus_licheniformis            -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Bacillus_subtilis                 -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Burkholderia_fungorum             -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Carboxydothermus_hydrogenoformans -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Chromobacterium_violaceum         -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Clostridium_thermocellum          -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Colwellia_psychrerythraea         -iER---------q-------F----------Gk------g----
Desulfotalea_psychrophila         -iQK---------q-------F----------Gk------g----
Enterococcus_faecalis             -iEK---------n-------F----------Gk------g----
Erwinia_carotovora                -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Haemophilus_ducreyi               -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Haemophilus_influenzae            -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Histophilus_somni                 -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Kineococcus_radiotolerans         -iDK---------n-------F----------Gk------g----
Leifsonia_xyli                    -iDR---------q-------F----------Gk------g----
Listeria_monocytogenes            -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Mannheimia_succiniciproducens     -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Neisseria_gonorrhoeae             -iEK---------s-------F----------Gk------g----
Nitrosomonas_europaea             -iEK---------q-------Y----------Gk------g----
Nitrosomonas_eutropha             -iEK---------q-------Y----------Gk------g----
Oceanobacillus_iheyensis          -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Pasteurella_multocida             -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Photobacterium_profundum          -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Photorhabdus_luminescens          -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Proteus_mirabilis                 -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Pseudomonas_aeruginosa            -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Pseudomonas_cepacia               -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Salmonella_typhi                  -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Shewanella_putrefaciens           -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Streptomyces_avermitilis          -iER---------q-------F----------Gk------g----
Streptomyces_coelicolor           -iER---------q-------F----------Gk------g----
Streptomyces_lividans             -iER---------q-------F----------Gk------g----
Vibrio_cholerae                   -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Vibrio_splendidus                 ---------------------------------------------
Vibrio_vulnificus                 -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Xanthomonas_vasicola              -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Xylella_fastidiosa                -iEK---------q-------F----------Gk------g----
Yersinia_pestis                   -iEK---------q-------F----------Gk------g----
===============================================================================
DEINOCOCCUS_RADIODURANS           -------------------------------------------si
Deinococcus_geothermalis          -------------------------------------------si
Thermus_aquaticus                 -------------------------------------------av
===============================================================================
Consensus                         xxeqxxxxxxxxxxxxxxxxxfxxxxxxxxxxgxxxxxxxxxxxx

Page 5 of 18